Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpm3Q5F4S9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trpm3Q5F4S9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpm3Q5F4S9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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Trpm3Q5F4S9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpm3Q5F4S9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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