Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtl5Q5DTT4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms