Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms