Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
E2f8Q58FA4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms