Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rtl6Q505G4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtl6Q505G4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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