Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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