Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms