Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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