Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Srsf6Q3TWW8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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