Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms