Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc13Q3TIR1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms