Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam107bQ3TGF2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms