Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax1Q2NKI2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax1Q2NKI2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms