Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms