Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VgfQ0VGU4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms