Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc21bQ0HA38 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms