Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NrepQ07475 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NrepQ07475 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms