Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cntn3Q07409 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms