Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Siah1bQ06985 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms