Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms