Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Nf1Q04690 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms