Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msx2Q03358 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms