Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms