Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms