Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nme2Q01768 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms