Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Top2aQ01320 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms