Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms