Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms