Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeleQ00690 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeleQ00690 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms