Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms