Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcc1P97496 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms