Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Prop1P97458 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prop1P97458 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prop1P97458 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prop1P97458 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prop1P97458 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prop1P97458 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prop1P97458 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prop1P97458 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Prop1P97458 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prop1P97458 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms