Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irx1P81068 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx1P81068 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms