Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms