Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms