Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms