Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd13P70217 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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