Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrig1P70193 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms