Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtnP63089 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtnP63089 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtnP63089 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms