Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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