Protein–RNA interactions for Protein: P61620

Sec61a1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a1P61620 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec61a1P61620 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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