Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atp5bP56480 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp5bP56480 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms