Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CdaP56389 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CdaP56389 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CdaP56389 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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