Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PctpP53808 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PctpP53808 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms