Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Efnb1P52795 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Efnb1P52795 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms