Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CastP51125 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CastP51125 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CastP51125 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CastP51125 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CastP51125 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CastP51125 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CastP51125 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CastP51125 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CastP51125 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CastP51125 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms