Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TspoP50637 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TspoP50637 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TspoP50637 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms