Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SftpdP50404 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SftpdP50404 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpdP50404 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms