Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LmnaP48678 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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