Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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